Illumina推出新型高通量仪器NovaSeqX

经过漫长的等待，Illumina发布了一系列新的测序仪器——NovaSeqX系列，旨在在激烈的竞争中巩固其作为下一代测序领导者的地位。

该公告是在本周于加利福尼亚州圣地亚哥举行的公司年会Illumina基因组学论坛的创新路线图会议上宣布的。该活动于周三以对前总统巴拉克奥巴马的头条采访开始。

Illumina的新测序系列包括一对新仪器——NovaSeqX和NovaSeqXPlus。区别?NovaSeqX使用单流动槽，而NovaSeqXplus使用双流动槽。然而，这两个流通池并不是独立运行的。Illumina副总裁兼全球产品管​​理负责人JasonJohnson告诉GEN，他们现在同时运行，但随着时间的推移将启用交错启动。

NovaSeqXplus将于2023年第一季度开始发货。尽管这些仪器在现有NovaSeq平台(NovaSeq6000)上具有相同的占地面积，但NovaSeqX是一个新系统，具有新的化学(不向后兼容)使用NovaSeq6000)，新型高分辨率光学器件和超高密度流通池。

NovaSeqX[Illumina]

NovaSeqXPlus与NovaSeq6000相比如何?以最高输出运行的NovaSeq6000将在44小时内生成6太字节(Tb)的数据。新的NovaSeqX将拥有10B(100亿簇)流动槽。当以2×150bp读取运行时，它也将输出6TB，但几乎是一半的时间(24小时)。在2023年下半年，Illumina计划推出25B的流动槽(簇/流动槽增加2.5倍)，将在48小时内输出16Tb的数据(8Tb/流动槽)。

NovaSeqXplus的标价为125万美元，而NovaSeqX的标价为985,000美元，与NovaSeq6000相当。Johnson声称用户的实际成本会更低，每个晶圆的流动槽更多，试剂更少每次运行。他说，有了最高输出的流动槽，客户将看到与NovaSeq6000S4相比，每千兆碱基(Gb)的成本降低了59%。按照标价，这是2.00美元/Gb，产生大约200美元的人类基因组(包括聚类、测序以及初级和二级分析。)

deCODEGenetics的创始人兼首席执行官KáriStefánsson医学博士说：“Illumina为我们提供了第一项技术，可以对数千乃至数十万个全基因组进行测序。新的NovaSeqX将使我们能够对整个国家的基因组进行测序。”

化学X

新平台可能与旧平台同名，但约翰逊表示相似之处仅此而已。与以前的仪器相比，“可能唯一的共同点就是Illumina标志!”

NovaSeqX使用的新化学物质在今年年初被戏称为“ChemistryX”，现在称为XLEAP-SBS。XLEAP-SBS是一项已有五年历史的计划的成果。Johnson说，虽然它仍然是边合成边测序(SBS)——由Illumina于2007年收购的英国公司Solexa开发的基本逐步化学——它具有新的聚合酶、阻断剂、接头和染料。

从2024年开始，XLEAP-SBS化学品将能够用于Illumina的NextSeq1000/2000仪器。为什么是NextSeq系列而不是NovaSeq6000?“为了让新化学能像我们希望的那样发挥作用，您需要更多先进的超高数值孔径和先进的光学器件。NextSeq1000/2000具备这一点，”Johnson解释道。

关于化学，Illumina仍然留有很多想象空间。约翰逊告诉GEN，该公司重新设计了拦截器以减少分相。而且它“重新设计了连接器和染料，使其更亮，使我们更容易非常准确地切割。”

Illumina表示，测序错误率和定相都降低了约50%。新的聚合酶比目前的酶快三倍。这些进步与NovaSeqX系列中更高功率的激光器和分期相结合。

Johnson说，Illumina测试了数百万次不同的迭代，同时致力于优化导致XLEAP-SBS的系统。在这样做的过程中，他们求助于从Solexa设计原始IlluminaSBS系统的团队的专业知识，其中许多人仍然是Illumina的员工。

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Illumina在论坛上还发布了一些其他公告。正如预期的那样，他们的长读技术Infinity将于2023年第一季度推出。长读有多长?他们看到的最长读数为30千碱基(kb)，但大多数在6–7kb左右。Infinity可用于NextSeq、NovaSeq6000和NovaSeqX。目标版本将于2023年下半年推出。

Illumina还宣布NovaSeq6000Dx是首款通过FDA注册并获得CE标志的体外诊断(IVD)高通量测序仪。

最后，该公司强调，NovaSeqX系列具有可在室温下运输的耐热试剂。这消除了对干冰的需求并减少了浪费。该公司注意到包装废物和重量减少了90%，塑料使用量减少了50%。

在论坛舞台上，Illumina强调客户会喜欢DRAGEN(Illumina的测序数据分析工具)集成在机上、整体通量和经济性以及新系统的可持续性元素。

当前的NovaSeq客户可能会抱怨NovaSeq6000上的XLEAP-SBS缺乏向后兼容性。但是，如果他们想要升级，Johnson指出该公司有促销活动，这取决于年龄和不同方面的交易，他们将与个别客户谈判。

怀疑论者可能指出没有任何早期用户。事实上，NovaSeqX尚未部署到现场。一旦进入用户手中，NovaSeqX将不得不做一些Illumina以前的仪器不必担心的事情——它必须参与竞争。